三聚磷酸钠是具有两种构型的，一种是称为I型（或α型，高温型），另一种则是称为II型（或β型，低温型）。由于结构上的那些差异，两种构型的三聚磷酸钠的水合速度相差是很大的，I型三聚磷酸钠水和快，II型三聚磷酸钠水合慢。由于工业生产出的三聚磷酸钠是I型和II的混合物，所以两者的比例就导致出了不同的水合速度。

另外，除了焦磷酸钠等磷酸盐杂质会对水合速度产生影响外，其它非磷酸盐杂质的存在也会对工业三聚磷酸钠的水合速度产生影响的，包括了原料和生产中国带来的杂质。三聚磷酸钠认为这些杂质的存在是会促进或抑制三聚磷酸钠的水合，所以要在生产中尽量去避免杂质的带入。

在其他形式的磷酸盐的含量中，实际生产出的三聚磷酸钠，通常是含有焦磷酸钠，偏磷酸钠，正磷酸钠等其他形式的磷酸盐，这部分磷酸盐的存在，除了造成成品的主含量降低外，还会对三聚磷酸钠的水合速度有影响的。

当三聚磷酸钠含有结晶水时，由于此结晶水是以六水五钠的形式存在，在与水合时，已存在的六水五钠起晶种的作用，因而就会促进水合反应的进行。在实验的测试中，当结晶水含量在0.5%时效果已明显，结晶水的含量低于0.5%时，对水合速度的促进效果是不够明显的，当结晶水含量超过0.5%对水合速度的促进效果是不再增加的。